宋咸平四年（1001）屬萬歲鄉(xiāng)；宋宣和二年（1120）萬歲鄉(xiāng)改名永壽鄉(xiāng)。

宣統(tǒng)二年（1910），永寧、永壽合為寧壽鎮(zhèn)。

1928年屬第三區(qū)。

1932年設立巍山鎮(zhèn)（稱巍山第一鎮(zhèn)、第二鎮(zhèn)、第三鎮(zhèn)）。

1935年，為十九都鄉(xiāng)。

1944年，調整為巍山鎮(zhèn)。

1958年9月稱巍山人民公社。

1959年6月13日復稱巍山鎮(zhèn)。

1988年1月1日巍屏、古光、象崗、胡村鄉(xiāng)并入。

1990年2月巍屏、古光、象崗、胡村4個辦事處恢復鄉(xiāng)建制（由巍山鎮(zhèn)代管）。

1992年5月，巍屏、古光、象崗、胡村鄉(xiāng)撤銷后復并入巍山鎮(zhèn)，撤銷羅山、懷魯鄉(xiāng)并建懷魯鎮(zhèn)。

2003年10月8日撤銷巍山鎮(zhèn)、懷魯鎮(zhèn)，合并建立巍山鎮(zhèn)。

2004年5月27日裘家?guī)X、廣東塢兩個村委托六石街道管轄（2006年4月正式劃出）。

2005年6月6日歌山鎮(zhèn)金鑫村委托巍山鎮(zhèn)管轄。

2006年，善部坑村從三單鄉(xiāng)整村遷移劃入，屬巍屏社區(qū)。